第二天，又是阳光明媚，鸟语花香的一天。正在家里做完早餐的正吾突然听到隔壁房子发出巨大的爆炸声，出门一看发现工藤家的墙塌了，此时工藤新一从楼上探出头来对着旁边的房子喊道：“阿笠博士，你能不能安分一点啊！”
此时一个背着一个飞行器的老伯从废墟里面爬了起来，“不好意思啊，想叫你起床，比起闹钟这样子才叫的起你啊。对不对啊。”这个老伯满脸笑容的说道。工藤一手扶脸，满脸无奈的叹了口气。
这时正吾出声了：“阿笠博士，工藤早啊。我正做好早餐要不要过来一起吃点啊！”
“哈哈正吾早上好啊！不好意思打扰到你了。”阿笠博士有点歉意的说道。
“没关系的，阿笠博士你可是很厉害的发明家哦。”正吾笑了笑表示没事。
此时工藤说道：“不了，我约了小兰一起吃早餐去上学，下回。”“好的。”然后工藤下来把阿笠博士附近了家里。
正吾也回到了自己的家里，吃完早餐然后开始了新的一天写作。大学那边已经打过招呼了，现在正吾已经复学了，但其他同学都出来参加实习了，所以他自己也申请了在家实习写小说。除了特定的日子回学校答辩和参加活动外，都可以自由活动（没见过日本大学的实习，我编的，勿喷）。
时间一晃一天过去了，正吾继续他的宅男生活。第二天傍晚太阳下山了才出门求便利店买生活用品。
回来的时候看到一个小朋友正在很努力的爬上去开门，这时后你工藤家旁边的博士家又发生了爆炸那小孩赶紧跑过去。
看来工藤新一变小了，这样子说四季时间不就要开始错乱了。想着想着正吾也走了过去，听到小朋友在说：“我是新一啊，我是新一啊。”阿笠博士站了起来：“新一亲戚家的孩子啊？新一的家就在隔壁啊。”正吾走了过去，开口问道：“博士需要帮忙吗？”
这时候小朋友大喊：“我就是新一，你不相信的话，我可以说出你家的事情，阿笠博士今年五十二岁，是著名的发明家，虽然自称天才，不过制造出的东西全部都是破铜烂铁，而且你屁股上的一颗痣还长着一根毛。”
“啊，正吾啊，这个小朋友出在了新一家的门口，而且是说出了新一才知道的秘密！”阿笠博士答道。
“阿笠博士是这样的，我就是新一我被人灌下奇怪的毒药结果人就变小了。”小柯南急到。
“你喝了要变小了？如果又那种药的话我也想亲眼瞧一下，奇怪的小鬼头我要带你去找警察。”博士不肯相信。
“正吾你过来帮我作证啊，你小时候来我家看书的时候我还和你一起玩的呢。”
“博士你要不先听他把话说完先嘛！或许他真的是新一哦，这的确是我和新一以前发生过的事呢。马上就要下雨了，要不先把他带进新一的家里说清楚先。”正吾无奈道。虽然他已经知道了这就是工藤新一，但也不能很确定的告诉其他人。
新一的家里，正吾和阿笠博士听完新一小朋友的叙述后。博士沉思了一下说道：“因为那个毒药还没发明完整，产生了不可思议的作用，所以导致了你的身体缩小了啊。”
小新一一边穿着小学生的衣服，一边张开双手摆弄道：“就是这样啊。真是的小学时期的衣服刚好合身。”
“博士拜托你了，你是个天才吧！帮我制造恢复原形的药啦”小新一可怜的说道。
博士摆摆手“这个是勉强不来的，不知道药的成分是不可能制造的出来的。”
小新一满怀希望的说：“那查明那伙黑衣人的所在之处，把药弄到手就有希望了。”
“这个嘛，或许会有帮助，但新一你知道嘛，那伙人知道你还活着的话，一定会来杀你的哦。”此时正吾说了一句。
“而且按照你所说的那样，那群人无法无天，到时候还会把你身边的人都杀了呢。你得谨慎行事，这件事情就当作是我们三个之间的秘密，我们帮你一起调查。但不能透露给更多的人知道了，不然会给他们带来危险，包括你的女朋友小兰。”正吾一脸严肃地说。
话音刚落，就听到了一阵喊声“新一你在里面吗？”小兰居然过来了。“快躲起来，别让小兰看见。”博士紧张的说道。
这时小兰走了进来：“如果在家就应该接电话啊真是的，啊，阿笠博士，正吾大哥你们都在啊，新一呢？”“他刚刚还在这里，可能是出去了吧。”正吾随意的说道。
这时在书桌后面传来碰的一声，“里头是不是有人啊？”小兰走了过去，“啊，是个害羞的小孩子哎，这孩子好可爱啊。”抱着小新一站了起来。“这孩子他是谁啊？”小兰转过身来问博士。
博士结结巴巴地说：“这是我远房亲戚家的孩子。”“小朋友你叫什么名字哦？”小兰转过头来问小新一。
小新一慌慌张张的看了一眼旁边的书说：“我的名字叫新，啊，不是的，我的名字叫做江户川柯南。”
“柯南？好奇怪的名字哦！”小兰有点疑惑地说。“啊，因为我的爸爸是柯南道尔的书迷，所以就。。。。。。”小柯南结结巴巴地说。
“总感觉和新一长得好像哦。”小兰想了想说道。
这时博士开口了“对了小兰，不好意思啊，我能把这个孩子寄养在你的家里一段时间吗？这个孩子的亲人因为意外事故住了院所以才摆脱我照顾，可是我毕竟是个单身汉嘛。”
小兰从地上站了起来：“可以是可以啦，不过我得和我爸爸商量一下。”
“是这样吗？那这就是你愿意接受咯，真是太好了。”博士高兴的说。
这是柯南拉着博士到旁边说起了悄悄话。这时正吾说道：“小兰你放心吧，工藤刚刚回来说有案件要调查所以又出去了，等下他会回你电话的。”
“嗯，希望如此。”小兰应了句。柯南和博士说完悄悄话后，就交由小兰带回家了。
正吾望着两人逐渐走远的身影，感受到了命运之轮还是转动了起来。